解:(1)∵在Rt△ABC中,∠C=90°,AC=BC,AD=BE,若AC=6,AD=4,
∴EC=6+4=10,CD=6-4=2,AC=BC=6,
∴S
△ADF-S
△BEF=S
△ABC-S
△CDE=

×6×6-

×2×10=8,
故答案为:8;
(2)∵在Rt△ABC中,∠C=90°,AC=BC,AD=BE,若AC=a,AD=3,
∴EC=a+3,CD=a-3,AC=BC=a,
∴S
△ADF-S
△BEF=S
△ABC-S
△CDE=

×a×a-

×(a-3)×(a+3)=

.
故答案为:

.
分析:(1)根据已知边长和三角形面积求法,得出S
△ADF-S
△BEF=S
△ABC-S
△CDE求出即可;
(2)根据已知若AC=a,AD=3,利用三角形面积求法,得出S
△ADF-S
△BEF=S
△ABC-S
△CDE求出即可.
点评:此题主要考查了三角形面积求法,根据已知得出三角形边长以及S
△ADF-S
△BEF=S
△ABC-S
△CDE是解题关键.