生物体内都有一种与呼吸作用有关的蛋白质——细胞色素C，它是由许多氨基酸组成的，科学家分析发现通过生物的细胞色素C的氨基酸组成的研究可以确定生物在进化过程中的亲缘关系。即物质组成越相似，说明他们的亲缘关系越近。下表是5种生物的细胞色素C与人的细胞色素C的组成比较。

请回答下列问题：

（1）人和           的亲缘关系最近，人和           的亲缘关系最远。对前者的判断依据是                                  。

（2）科学家通过分析生物的细胞色素C的氨基酸组成差异来研究生物进化的方法是                。

（3）除生物的细胞色素C的氨基酸组成差异可以作为生物进化的证据外，研究生物进化的非常重要的证据还有            。

与植物细胞相同，人和动物细胞的细胞质中也有与呼吸作用有关的________。